Data Statistiques R
ACP : morphologie des crabes
Analyse en composantes principales de 200 crabes (5 mesures morphologiques) pour dégager les structures de taille et de forme entre espèces et sexes.
Points clés
- PC1 capte 95,8 % de l'inertie : un effet taille commun à toutes les mesures.
- PC2 oppose la largeur postérieure (RW) au reste : un axe de forme.
- Le 2e axe sépare les espèces bleue et orange.
- ACP normée sur la matrice de corrélation, avec variables et individus supplémentaires.
Problème
Cinq mesures morphologiques très corrélées relevées sur 200 crabes : comment réduire la dimension, synthétiser l'information et séparer l'effet de taille de l'effet de forme entre espèces et sexes ?
Mon rôle
Analyse complète en R : exploration et corrélations, ACP normée, interprétation des axes, puis projection de variables et d'individus supplémentaires (espèce, sexe).
Stack
- R
- FactoMineR
- factoextra
- MASS
Résultat
Le 1er axe capte 95,8 % de l'inertie (effet taille commun à toutes les mesures) ; le 2e axe oppose la largeur postérieure (RW) aux autres variables et distingue les espèces bleue et orange.